罚与赎的少女
5年前，姐姐不知何故突然自杀，独眼少年皋月驱失去了唯一的亲人。 由于青梅竹马水奈濑由佳及其养父母无私地给予帮助，驱得以继续过着平静的日子。然而，驱内心仍然因姐姐的死亡而充满空虚感，对未来不抱任何希望地过着怠惰的日子。
而时间过了不久，在两人一起就读学园的日子里，命运发生了戏剧性的变化。 在毫无征兆的情况下， 两人被卷入了一个令人毛骨悚然的异世界里。街上没有了人影，周围成了一片寂静的废墟。 赤红的天空中只有一轮漆黑的月亮。在这个荒凉的”赤夜”世界里，代替人存在的是令人毛骨悚然的暗精灵们。不仅如此，在经历过九死一生的逃亡后，回到现实世界的他们发现，本应该存在于“赤夜”世界的天空的巨大黑月，竟随着他们来到了现实世界。
驱与由佳在逃命的途中发现了其他进入”赤夜”世界的人——会操纵阴阳术消灭暗精灵的 阴阳师草壁美铃、能够召唤出守护天使的橘菊理、背负着神秘经历，且有着惊人自愈能力的广原雪子、有着自由操纵火焰力量的田岛贤久。在 “赤夜”世界里遇到的伙伴们，都是驱与由佳无法想象的超能力者，并且都是绫女丘市虹陵馆学园的学生。后来，他们发现一定时间过去后可以从”赤夜”世界回到现实世界，但进入”赤夜”的时间总是很突然。暂时没有发现特殊能力，甚至可能根本就没有特殊能力的由佳和驱时常暴露在危险之中。 能出入”赤夜”世界的人包含驱共6人。 因为相同的命运，并且都在虹陵馆学园就读，为了联络方便，众人加入了雪子的“考现学社”，六人齐心协力，共同面对突如其来的危机。
在这个充满恐怖的“赤夜”世界里，除了四处徘徊着的暗精灵，更有六位力量强大的、与暗精灵全然不同的敌人伺机狙杀他们。这六位恐怖的，被主角们称作“黑骑士”的敌人仿佛拥有人的意识，并且会使用人类的语言。而“黑骑士”们将主角们称为“碎片”，并不惜一切代价将其消灭。
“黑骑士”们到底是何方神圣，而其目的又是什么？主角们又因为什么原因而被卷入这个被“赤夜”所笼罩的世界呢？主角们的能力又是从何而来？当面对不可抗力所限定的命运的轨迹时，主角们最终又将做出怎样的决定呢？是默然接受，还是用尽全力去改变一切？随着剧情的展开，一切都将呈现在玩家眼前。
虚空镜界
在班中默默无闻的天见修，其真实身份竟是现代魔术师！他隐藏自己的身份，过着平淡的学园生活。
某日，天见修被班中的吾妻汐音叫到楼顶，对修表白。
一句告白，竟使修身陷暴露身份的泥潭，麻烦接踵而至，西洋魔术师的到来，两个香央里的出现，奇怪的世界···让他再也无法置身事外。
修是否能探明这一切的真相？这一切究竟有什么必然的联系？
整个故事与罪与罚几乎同时进行，匡、驱和由佳将友情客串，而百野栞与奈月香央里将以女主角身份参与其中。
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